Cetáceos de hábitos costeiros estão mais sujeitos aos impactos de origem antrópica. Considerando a intensa utilização da Baía da Babitonga para diversas atividades humanas, o presente trabalho consiste no monitoramento dos parâmetros populacionais de Sotalia guianensis e Pontoporia blainvillei. O método aplicado para a obtenção dos dados foi o de transectos lineares. Foram definidos 11 transectos a serem percorridos, concentrando os esforços de campo nas áreas conhecidamente de maior ocorrência das espécies. Foram realizados treinamentos de estimativa visual de distância e amostragens piloto em transectos alternativos nomeados TPs de 1 a 6. Na amostra piloto foram avistados 12 grupos, totalizando 59 indivíduos. Destes, 6 eram grupos de S. guianensis, somando 40 indivíduos, e 6 eram grupos de P. blainvillei, somando 19 indivíduos. A primeira amostragem correspondeu ao inverno, quando foram percorridos 72,3Km em esforço. Nas amostragens realizadas nos 11 transectos definidos para o monitoramento foram avistados 14 grupos, totalizando 43 indivíduos. Destes, 11 grupos eram de S.guianensis, somando 33 indivíduos, e 3 eram grupos de P. blainvillei, somando 10 indivíduos. Na análise dos dados no programa Distance 4.1â foram utilizados os dados das duas espécies, obtidos nos pilotos e nos transectos definitivos. Estimou-se um tamanho de grupo médio de 3,4 indivíduos (95% IC: 2,5952 - 4,5464). Para densidade populacional foram estimados 7,1 ind./Km² (95% IC: 3,9837 - 12,849), enquanto os anos anteriores apresentaram para S. guianensis 1,446 ind./Km² (95% IC: 0,917 - 2,28) (2001); 0,857 ind./Km² (95% IC: 0,49 - 1,5) (2002) e 0,962 ind./Km² (95% IC: 0,446 - 2,075) (2003). Para abundância estimou-se 572 (95% IC: 319 – 1028) indivíduos. Já nos anos anteriores para S. guianensis estimou-se 231 (95% IC: 147 – 365) (2001), 137 (95% IC: 78 – 240) (2002) e 154 (95%IC: 71 – 332) (2003) indivíduos. Considerando que este trabalho analisou dados obtidos apenas nas áreas de concentração, associado ao fato das duas espécies terem sido analisadas conjuntamente, era esperado que a densidade fosse muito superior aquela registrada para S. guianensis. Além disso, contribuiu na discrepância do parâmetro abundância o baixo n amostral.