Os bancos ou baixios intermareais são ambientes de transição em áreas protegidas, como é o caso dos estuários. Nesses ambientes se estabelecem muitas espécies de bivalves de interesse comercial e que muitas vezes são a base da dieta de muitas famílias que habitam as regiões costeiras do Brasil. O objetivo do trabalho foi caracterizar as comunidades macrobentônicas e planctônicas no outono em um banco lodoso na Vila da Glória, localizado na baía da Babitonga, estado de Santa Catarina. A amostragem da macrofauna bentônica ocorreu na área não vegetada do baixio em dois transectos distanciados em 20 metros, dispostos perpendicularmente à linha d’água. Em cada transecto, a partir do limite com a vegetação foram distribuídos três pontos a cada 30 metros. As amostras foram retiradas com um cilindro de aço de 25 cm de diâmetro por 15 cm de altura e lavadas em campo com uma sacola de malha de abertura de 500 µm e fixadas em formalina 10% para posterior triagem e identificação. Nos mesmos pontos foram coletadas amostras de sedimento para determinar a concentração de matéria orgânica e a água de percolação foi coletada para determinar a salinidade e a temperatura. As amostras de plâncton e da coluna d’água foram coletadas em três pontos próximos aos pontos de amostragem da macrofauna bentônica. Foram filtradas alíquotas de 100ml para a determinação da clorofila-a. Para coletar as amostras de zooplâncton e ictioplâncton utilizou-se redes cônica e cilíndrico-cônica. A salinidade e temperatura do sedimento variaram de 28 a 30 e de 18 a 19°C. As concentrações de matéria orgânica variaram de 0,55 a 1,34%. Na macrofauna foram identificados 11 táxons. Anomalocardia brasiliana e Heleobia australis foram dominantes. A profundidade média foi 1,05m e a transparência 0,75m. As médias para oxigênio dissolvido, temperatura, salinidade e pH em superfície foram, respectivamente, 7,14, 21,12ºC, 25,20 e 8,25. A concentração média de clorofila-a foi 14,08µg/L. O biovolume médio de zooplâncton foi 25,08mL/10m³. Para o ictioplâncton foram registradas densidades médias de 9,73ovos/10m³ e 0,69larvas/10m³. Os resultados caracterizaram o outono, em uma área de importância sócio-econômica devido à presença de juvenis de Anomalocardia brasiliana, que mesmo explorada, dominou nas amostras.