A atmosfera vem servindo como depósito para material descartado, recebendo gases resultantes da queima e de fermentadores, dispersando e depositando material particulado, e pela ação solar digerindo substâncias e devolvendo ao solo o produto de seu trabalho, por meio das chuvas. A ação antrópica interfere nesse sistema, consumindo recursos exógenos e descartando, de forma maciça, resíduos que por vezes não encontram na natureza a degradação na mesma velocidade em que são gerados (MANFREDI, 2004). A dinâmica da atmosfera é complexa, e envolve processos de emissão, transporte, transformação química e deposição de poluentes, desse modo, a composição química de um evento de precipitação é o resultado da interação destes processos, exigindo uma visão ampla integrada. Somam-se a isso, fatores meteorológicos como: direção dos ventos, temperatura, umidade relativa, intensidade da radiação solar, percurso e altitude das nuvens, intensidade da chuva e tamanho das gotas que afetam os processos de transformação, dispersão e remoção de poluentes atmosféricos (FINLAYSON-PITTS e PITTS, 1986; SEINFELD e PANDIS, 1998 apud SILVA, 2005). A bacia hidrográfica do Rio Cachoeira corta a área urbana de Joinville e é caracterizada pela presença de indústrias dos setores têxtil, metal-mecânico e de plástico. O presente trabalho foi integrado ao projeto HIDROC com o objetivo de caracterizar a emissão de poluentes por diferentes fontes existentes na região, por meio de um inventário das principais fontes poluidoras, estudo meteorológico, biomonitoramento e amostragens de qualidade do ar. As amostragens ocorreram em dois pertencentes à Bacia Hidrográfica do Rio Cachoeira, tendo-se por objetivo estimar o aporte atmosférico de material particulado (totalizaram-se 14 amostras), ânions cloreto (Cl-), nitrato (NO3-) e sulfato (SO42-) presentes na água da chuva (68 amostras) potencialmente oriundos da deposição de poluentes decorrentes das emissões antrópicas na região, assim como o impacto sobre organismos vivos, por meio de biomonitoramento. Os resultados das análises das amostras de água da chuva e biomonitoramento indicaram que a qualidade do ar no munícipio encontra-se sob forte influência antrópica devido às indústrias e à combustão por veículos automotores, destacando-se a presença de compostos nitrogenados, assim como de alguns compostos de aerossóis de origem marinha, visto que o munícipio recebe muitas correntes de ar advindas do leste. Os dados obtidos com as amostragens de material particulado alertam sobre a necessidade de se estabelecer um monitoramento constante em diferentes pontos do município, de maneira a garantir segurança ambiental, ferramentas para gestão urbana e melhora da qualidade de vida.