Raulinoa echinata R. S. Cowan (Rutaceae) é espécie reofítica endêmica do vale do Itajaí, tendo sua distribuição restrita às margens e ilhas fluviais do rio Itajaí-açu, em faixa de até 15m do nível médio da água, entre os municípios de Apiúna e Ibirama, em Santa Catarina. Cinco populações distintas ocorrem – Ilha das Cutias, Tipo, Morro Santa Cruz, Apiúna e Ilha Knaesel – distribuídas por cerca de 50km ao longo do rio. As características anatômicas do lenho de raiz e caule e as possíveis variações entre as plantas das cinco populações poderão ajudar a identificar as estratégias que permitem a sobrevivência da espécie no ambiente reofítico reconhecendo seu papel como bioindicadora de condições ecológicas e/ou ambientais tão específicas. Desta forma, características qualitativas e quantitativas do lenho de raiz e caule das cinco populações foram analisadas em lâminas permanentes montadas pela técnica usual com cortes histológicos e material macerado e comparadas pelo Teste-Tuckey. Discos de madeira do caule foram polidos para a contagem dos anéis de crescimento. O lenho, tanto de raiz como de caule, apresenta camadas de crescimento pouco distintas, em linhas marginais intercaladas por parênquima axial paratraqueal escasso. Foram contadas até 18 camadas, indicando que os ramos não atingem idade muito avançada, provavelmente sendo substituídos periodicamente por novos em função de danos causados pela correnteza do rio. A porosidade é difusa e os vasos solitários e múltiplos radiais de 2-3. No lenho de caule, o diâmetro tangencial dos elementos de vasos apresentou diferença significativa entre as populações Ilha das Cutias (17µm) e Ilha Knaesel (45µm). O comprimento dos elementos de vaso apresentou diferença significativa entre a população Apiúna (240µm) com Ilhas Knaesel (279µm) e Tipo (367µm). O comprimento das fibras é considerado de curto a médio e não se verificou diferença significativa entre as populações. Os raios são multisseriados com 1-3 células de largura, com células procumbentes e 2-4 camadas de células quadradas ou eretas, sem diferença estatisticamente significativa entre os órgãos, porém no caule a média de altura é menor que na raiz, devido à menor necessidade de tecidos mecânicos de sustentação, como fibras. O lenho de raiz apresenta um padrão xeromórfico, consequência do fato de as plantas enfrentarem déficit hídrico em época de vazante, sendo esta uma das estratégias para a sobrevivência da planta em locais de baixa disponibilidade de água. As populações geograficamente mais distantes podem ser distinguidas por algumas características anatômicas quantitativas diferentes.