A água é usada para diversos fins, principalmente na sobrevivência do homem. Contudo, a ocupação do solo sem devido tratos conservacionistas provocam alterações na sua qualidade e induzem a poluição das mesmas. A poluição da água é dividida em duas categorias: pontuais e fontes difusas, podendo ser de origem antrópica ou natural. A Política Nacional de Recursos Hídricos de 1997 propõe a gestão das águas de forma participativa e descentralizada por meio dos Comitês de Bacia. A Bacia do Rio Cubatão, situada no norte do estado de Santa Catarina, abrange os municípios de Joinville e Garuva sendo responsável pelo abastecimento de 70% da região de Joinville maior cidade do estado é gerenciada pelo Comitê de Gerenciamento dos Rios Cubatão e Cachoeira – CCJ e com a finalidade de atuar nos conflitos de uso possui equipe técnica de extensionistas e pesquisadores em parceria com a Universidade da Região de Joinville – UNIVILLE que realiza monitoramento da qualidade de águas. Como metodologia são realizadas coletas em oito pontos estratégicos da bacia, sendo estes em perímetros rurais e urbanos desde a nascente até sua foz. O monitoramento é realizado em períodos mensais, trimestrais e anuais, e em média são monitorados cinquenta parâmetros, sendo físicos, químicos e biológicos considerando a Resolução CONAMA 357/2005. Para a análise de apresentação dos dados utiliza-se o Índice de Qualidade de Água – IQA, proposto pela Companhia de Saneamento de São Paulo - CETESB, versão modificada da original desenvolvida pela National Sanitation Fundation. O cálculo de IQA consiste em um produtório de notas individuais, que podem ser classificadas em ótima, boa, regular, ruim ou péssima. Os resultados para o ano de 2018/2019 mostraram que dos oitos pontos de monitoramento, sete possuíam média de qualidade de água boa, enquanto apenas um ponto de coleta, média regular. Considera-se como principal fator desse bom resultado o fato de que a bacia está parcialmente inserida em uma área de proteção ambiental, enquanto que apenas um quarto está em área urbanas e com proximidade de um polo industrial. Quanto ao ponto em que se verificou a qualidade regular observa-se que este localiza-se em região urbanizada e com precariedade do sistema de esgotamento sanitário reforçando a eficácia destes sistemas de proteção e controle ambiental na garantia de melhoria da qualidade da água um bem público de direito de todos e essencial a vida.