O Sistema de Informação Geográfica (SIG) constitui-se numa ferramenta útil na organização e espacialização de dados, sendo bastante utilizado na área de pesquisa e no planejamento e gerenciamento costeiro. O presente trabalho teve como objetivo elaborar um SIG para a Baia da Babitonga com ênfase em dados ambientais do meio físico e biológico. A Baia da Babitonga é um complexo estuarino de cerca de 180 Km² de superfície aquosa, que abriga diversos ecossistemas litorâneos, tais como manguezais, canais estuarinos, praias e ilhas. Também ocorrem na baia, atividades dos setores pesqueiro, aquícola, portuário, náutico e turismo, denotando sua grande importância ambiental e socioeconômica. A elaboração do SIG da Baia da Babitonga foi efetuada em 5 etapas: a) levantamento de dados; b)Organização de metadados e espacialização c) geração de modelo conceitual; d) aplicação das regras e vínculos e) geração de modelo de dados. O tipo de modelo de dados utilizado foi o de objeto orientado, com o uso do Programa Arc INFO v9.1, o qual o modelo de dados estrutura-se em formato geodatabase. Foi considerado como limite distal do sistema, a isóbata de 15 metros que delimita a feição de delta de maré vazante. Os trabalhos levantados estão divididos nos seguintes temas: Oceanografia, Geografia, Ecologia e Biologia, com o predomínio da ultima área. A definição de objetos de primeira hierarquia espacial adotada no SIG foi a compartimentação em 3 setores: Canal Principal, Canal do Palmital e (antigo) Canal do Linguado, já reconhecida na literatura científica. A organização do sistema foi estruturada pela base cartográfica na escala de 1:50.000 proveniente do IBGE (altimetria, malha viária e hidrografia) e Marinha do Brasil-DHN (batimetria). Um total de 20 temas constituem o componente que abrange os dados ambientais. A maior parte das estruturas vinculadas entre si, compõe uma malha de pontos que representam diferentes estações amostrais dos trabalhos levantados. Nesta malha, as maiores lacunas espaciais mais significativas, ocorrem no Canal do Palmital, e na porção proximal do canal principal. Desta forma, este SIG permite realizar pesquisas e análise de visualização espacial, bem como, a inserção de novos dados na malha de pontos existentes, e dados de polilinhas e polígonos, com extensão para comportar séries temporais. De posse dos dados organizados no SIG da Baia da Babitonga vislumbra-se também a possibilidade de realizar modelagem espacial dos dados, afim de gerar subsídios ao gerencimento costeiro, entre outras políticas e planos ambientais.