A Universidade da Região de Joinville – Univille vem intensificando na última década as ações de ensino, pesquisa e extensão na região do complexo estuarino baía da Babitonga. Da necessidade de integrar os projetos desenvolvidos, dar suporte aos pesquisadores e instituições parceiras, bem como garantir a continuidade das atividades foi criado em 2002 o Programa Institucional Babitonga. Este programa visa uma atuação conjunta e interdisciplinar envolvendo as áreas sócio-econômica, histórico-cultural e ambiental no que se referem ao estudo do Complexo Hídrico da Baía de Babitonga e adjacências. Os principais objetivos são intensificar a relação entre ensino, pesquisa e extensão, implementar as ações propostas no Projeto UNIVILLE, interferindo na realidade social e colaborando no desenvolvimento integral da Região de Joinville, viabilizar o intercâmbio de professores, pesquisadores e estudantes da UNIVILLE e instituições parceiras e otimizar a utilização da infra-estrutura da UNIVILLE na área ambiental, a exemplo os CEPAs (Centros de Estudos e Pesquisas Ambientais na Vila da Glória e São Bento do Sul) e a Unidade Iperoba em São Francisco do Sul. Atualmente vários projetos são desenvolvidos com recursos do edital do próprio programa e de órgãos de fomento externo. A integração de ensino, pesquisa e extensão vem sendo consolidada através dos freqüentes cursos de extensão promovidos com participação de alunos e professores de diversos cursos da nossa instituição e professores convidados de renome internacional. Estas práticas trazem para as salas de aula e laboratórios resultados recentes das pesquisas realizadas em âmbito regional e internacional, promovem o contato de alunos e professores entre os departamentos da Univille, fortalecem as parcerias com outras instituições e criam novas possibilidades de pesquisas em conjunto bem como intercâmbio de alunos, pesquisadores e professores.