Plantas não possuem composição química uniforme, sendo quatro os fatores relacionados às alterações no tipo e quantidade de compostos secundários: genótipo, fase do ciclo vegetativo, fatores ambientais e práticas agrícolas. As plantas estão sujeitas às influências do solo, de onde obtêm água, sais minerais e, sob determinadas condições, poluentes. O município de Joinville / SC cresceu no entorno da Bacia Hidrográfica do Rio Cachoeira, que abrange 83,12 km², sendo que as porções urbana e industrial da cidade ocupam a região central desta bacia. Uma vez que este rio recebe a maior carga poluidora do município, pretendeu-se verificar se há variação na composição química de três espécies de plantas que compõem sua vegetação ciliar, em relação a exemplares destas espécies cultivados no Horto de Plantas Medicinais da UNIVILLE. Foram identificados e marcados três indivíduos de pariparoba (Potomorphe umbelata (L.) Miq.), goiaba (Psidium guajava L.) e saia branca (Brugmansia suaveolens (Humb. & Bonpl. ex Willd.) Bercht. & J. Presl) às margens do Rio Cachoeira, na região central de Joinville e três na UNIVILLE, para coleta e análise de folhas na primavera de 2013 e outono de 2014. As amostras coletadas foram fixadas em FAA para análise estrutural, realizada de acordo com técnicas usuais em microscopia. Para as análises histoquímicas utilizaram-se amostras frescas, nas quais pesquisou-se a presença de alcalóides, amido, compostos fenólicos gerais, lipídios ácidos e neutros, taninos e terpenos. Nas análises estruturais não foram observadas diferenças significativas entre as plantas cultivadas às margens do Rio Cachoeira e aquelas da UNIVILLE. Entretanto, em todos os casos verificou-se aumento no número de cristais nas amostras da UNIVILLE. Nas amostras de pariparoba da UNIVILLE, há tricomas tectores pluricelulares unisseriados com célula apical arredondada; e pluricelulares unisseriados com célula apical afilada em ambas as faces da epiderme da nervura central. As análises histoquímicas nas três espécies mostraram variação na histolocalização dos compostos secundários devido ao local e época de coleta. Dependendo do composto, sua presença e distribuição podem variar em função do local de coleta (alcaloides e lipídios da goiaba, amido e taninos da pariparoba, e taninos e terpenos da saia branca) e da estação do ano (lipídios e terpenos da goiaba, alcaloides, amido e lipídios da pariparoba, e compostos fenólicos da saia branca). Deve-se considerar estas informações quando se pretende fazer uso medicinal de alguma planta, uma vez que fatores ambientais podem interferir na concentração e distribuição dos compostos ativos, afetando seu potencial terapêutico.