O biguá Phalacrocorax brasilianus é uma ave aquática e pertence à família Phalacrocoracidae, com ampla distribuição neotropical. Os indivíduos possuem plumagem predominante preta, comprimento de 15 cm e sua vocalização forte se assemelha a um porco. Phalacrocorax brasilianus pode ser encontrado em zonas costeiras, estuários, lagoas, rios, represas e lagos. A identificação dos locais utilizados por uma espécie é uma ferramenta valiosa na conservação da biodiversidade, pois alterações nos padrões das populações podem servir como indicadores da qualidade ambiental. As informações existentes sobre a biologia do biguá no país são precárias, mesmo sendo esta uma espécie comum nos levantamentos ornitológicos do Brasil. A avaliação do status populacional de P. brasillanus na Baía da Babitonga é de suma relevância, pois sua ocorrência na região é muito freqüente. O objetivo desse trabalho foi avaliar a ocorrência de flutuações sazonais e caracterizar a distribuição da população de P. brasilianus na Baía da Babitonga, litoral norte catarinense. As amostragens foram feitas quinzenalmente, no período de 2006 a 2009. Foi utilizado um barco a motor que percorreu uma rota pré-definida junto às margens. Com auxílio de binóculos (7x35), foi feita a varredura das margens por dois observadores. Foi registrada a posição geográfica e o número de indivíduos para cada avistagem. Para a análise de dados foi calculada a abundância relativa e a freqüência de ocorrência da espécie ao longo dos meses amostrados e nos diferentes ambientes. A maior abundância relativa foi de 0,36% e 0,25% para as estações de primavera e verão, respectivamente, e a freqüência de ocorrência foi de 100% para todas as estações. O ambiente mais utilizado foi a região do Canal do Linguado onde a abundância relativa foi de 65%, seguido da região da Gamboa, com 22%, e a região do Monte de Trigo, com 5%. O número máximo de indivíduos avistados foi de 6.048 no dia 31 de março de 2009. O estuário da Baía da Babitonga abriga uma população considerável de P. brasilianus com a ocorrência de grupos com milhares de indivíduos. Foi registrada a ocorrência de flutuações sazonais na população de P. brasilianus no período, com a maior abundância na primavera e no verão. Também foram identificadas áreas de uso preferencial da espécie.