A crescente preocupação com os chamados “poluentes emergentes” desperta atenção para uma classe em especial: os medicamentos. Eles chegam ao meio ambiente a partir do descarte doméstico ou a partir das sobras geradas na produção de fármacos. Em pequenas concentrações na ordem de microgramas por litro (mg L-1) ou inferiores, ou seja, concentrações não efetivas a curto prazo em termos de resposta biológica em seres humanos, podem causar grandes impactos no meio ambiente partir da exposição crônica. O objetivo deste trabalho foi abordar o possível risco de contaminação de efluentes pelo lançamento dos dejetos brutos da produção de medicamentos em pequena escala, por farmácias de manipulação, identificando possível ecotoxicicidade através do biomonitoramento de algas Euglena gracillis, e investigar os impactos apresentados sobre o comportamento e as alterações no processo de fotossíntese e comparar os resultados obtidos com as literaturas afins. Amostras de quatro laboratórios de uma farmácia de manipulação foram analisadas comparando-se a demanda semestral. As alterações comportamentais (velocidade de subida a superfície, r-value e velocidade de movimento) das algas foram monitoradas por meio do biomonitoramento NG-TOX e os parâmetros de fotossíntese foram medidos através do fluorímetro de pulso e amplitude modulada (PAM). Os resultados demonstraram que o efluente do laboratório de hormônios, que teve uma baixa produção semestral, apresentou pouco impacto, já o efluente do laboratório de psicotrópicos, mesmo com demanda intermediária, apresentou impacto significante sobre o comportamento e a atividade fotossintética das algas. A diferença de comportamento observada entre os diferentes setores demonstra que os impactos e os possíveis riscos ambientais são diferentes para cada setor. Conclusão: A demanda e as diferentes substâncias manipuladas podem ser determinantes na classificação de risco e na escolha dos métodos de descontaminação. Testes em outros níveis tróficos se fazem necessário para confirmar a tendência observada.