Da mesma forma que os recursos hídricos superficiais, as águas subterrânea também contribuem com descargas dos continentes diretamente para o oceano, sempre que um aqüífero costeiro estiver interligado com o fundo mar. As Descargas de Águas Subterrâneas (SGDs) são consideradas um fluxo de água em margens continentais, independente da composição do fluido ou da força direcionadora. Por isso sua composição pode variar, podendo ser água doce descarregando no fundo do oceano, água de maré recirculada ou uma combinação dessas duas, as quais poderão reagir com elementos presentes nos sedimentos, aumentando consideravelmente as concentrações dos nutrientes, carbono e dos metais nesses fluidos. Desta maneira, as SGDs tornam-se uma fonte de constituintes importantes do ponto de vista biogeoquímico para zona costeira. Metodologias gráficas e estatísticas são utilizadas para classificar amostras de água em grupos homogêneos. Da mesma forma que o PHREEQC, o Hydrowin é um software desenvolvido para simular as reações químicas e processos de transporte em águas naturais ou poluídas, usado para calcular índices de saturação e a distribuição de espécies aquosas. Este programa é baseado no equilíbrio químico de soluções aquosas interagindo com minerais, gases, soluções sólidas, trocadores e superfícies de sorção, mas também inclui a capacidade de modelagem cinética das reações, troca iônica e de dados termodinâmicos através de cálculo, usando equações especificas. O Hydrowin usa equações termodinâmicas para classificar as águas em diferentes tipos e portanto, pode ser utilizado para analisar as interações químicas de águas de diferentes origens. A partir da utilização deste programa pretende-se avaliar a interação de águas já coletadas no complexo hídrico da Baía da Babitonga (inclusive em pontos que sugerem a existência de SGDs) ao longo de diferentes períodos experimentais, possibilitando um maior acerto na avaliação e discussão de resultados baseados em parâmetros de ensaio, contribuindo para estudos na área de oceanografia, modelos de avaliação de impacto ambiental em regiões costeiras e estuarinas.